ในเกมStar Trek Online นี้ผู้เล่นจะได้รับบทบาทเป็นกัปตันของเรือรบที่มีชื่อว่า Starship เป็นของผู้เล่นเอง ผู้เล่นจะได้ผจญภัยในอวกาศและดินแดนลึกลับเหมือนกับในหนังเรื่อง Star Trek และมีการสำรวจโลกใหม่ที่แปลกใหม่ หาชีวิตใหม่และอารยธรรมใหม่มากมายในการขยายจักรวาล
ใน Star Trek Online นี้ เป็นครั้งแรก AAA MMO กับสถานที่พื้นที่และสามารถต่อสู้กับผู้เล่นคนอื่นได้ ทุกสถานที่ภายในเกม บนพื้นดินผู้เล่นจะสามารถที่จะนำทีมของคุณออกไปในภูมิประเทศต่างๆได้ โดยมีการโต้ตอบกับพันธมิตรและศัตรูรอคอยผู้เล่นอยู่
